Центр колективного користування науковим обладнанням ЧДТУ є структурним підрозділом університету, діяльність якого організовує науковий керівник Центру.
До структури ЦКК входить комплекс науково-дослідних і навчально-наукових лабораторій, сформованих за профільними напрямами досліджень. Лабораторії забезпечують проведення інформаційних, інженерних, аналітичних, хімічних, біотехнологічних, метрологічних та інших міждисциплінарних досліджень.
Наукове обладнання Центру закріплюється за відповідними структурними підрозділами університету, які забезпечують його збереження, технічне обслуговування та належну експлуатацію. Роботу на обладнанні здійснюють відповідальні оператори та кваліфіковані працівники лабораторій. Координація діяльності лабораторій, розгляд заявок і організація доступу користувачів до обладнання покладаються на керівництво Центру.
Така структура забезпечує ефективне спільне використання наукової інфраструктури, взаємодію підрозділів університету та виконання комплексних досліджень.